BIN310 Utvalgte emner i mikrobiell genomikk

NMBU →10 studiepoeng

Studentvurdering

Hvor relevant opplever du emnet?

Gjennomsnittlig svar: ingen svar

Svært irrelevantSvært relevant

Hva er ditt generelle inntrykk av kurset?

Gjennomsnittlig svar: ingen svar

Svært dårligSvært bra

Hva synes du om emnets nivå?

Gjennomsnittlig svar: ingen svar

Svært lettSvært vanskelig

Hva synes du om arbeidsmengden sett i forhold til antall studiepoeng?

Gjennomsnittlig svar: ingen svar

Svært litenSvært stor

KARAKTERFORDELING · H 2025

41 kandidater

Bestått

Ikke bestått

H 2017

H 2025

Grupper etter kjønn

SEMESTER

STRYKPROSENT

12,3 %

NMBU snitt: 4,1 %

KANDIDATER PER ÅR

snitt over 6 år

SEMESTRE MED DATA

Eksamen og forkunnskaper

Vurderingen består av

En muntlig prøve
Langsgående vurdering
Mappevurdering
Selvstendige oppgaver

Alle delene må normalt være bestått. Karakterfordelingen over gjelder emnet samlet.

Kilde: Data hentet fra Felles studentsystem ved NMBU, slik den var publisert for høsten 2026. NMBU har ikke kvalitetssikret og er ikke ansvarlig for innholdet på denne siden.

Om BIN310

NMBU sin egen emnebeskrivelse — læringsutbytte, innhold og vurderingsform.

Emnets innhold

Moderne sekvenseringsteknologi, shotgun og amplicon-sekvensering.
Assemblering og annotering av prokaryote genomer og metagenomer.
Komparativ genomikk og metagenomikk.
Analyse av data fra mikrobielle samfunn.
Bruk av tungregne-ressurser.

Kompetanse i bioinformatikk kan brukes for bidra til alle bærekraftsmål som innvolerer biologi (helse, mat, natur).

Vis resten (30 avsnitt)

Link til informasjon om emnet

http://www.umb.no/?avd=12&visemne=BIN310&language=nb&deflang=1

1. Undervisning/læringsutbytte:

5,6

Læringsutbytte

KUNNSKAPER:

Skal kjenne til en rekke relevante bioinformatiske verktøy som benyttes innen mikrobiell genomikk, samt ideene bak de vanligste algoritmene knyttet til disse.
Bli kjent med et UNIX regne-cluster og enkel bruk av shell-scripting.
Kjenne til noen vanlige statistiske metoder for metagenomstudier og anvende disse på reelle data gjennom bruk av R og R-pakker.

FERDIGHETER:

Studentene skal kunne anvende elementer av temaene over til å løse problemer i prosjektoppgaver i emnet.
Lage enkle script i shell og R og kjøre tyngre analyser på et UNIX regne-cluster.
Studentene skal kunne presentere fagaktuelt materiale, både muntlig og skriftlig.

GENERELL KOMPETANSE:

Kunne sette seg inn i framtidens pipelines for (meta)genomstudier.
Praktisk programmeringskompetanse rettet mot analyse av bio-data.

Anbefalte forkunnskaper

Programmering, samt statistikk utover introduksjonsnivå.

Forutsatte forkunnskaper

Introduksjon til bioinformatikk (BIN210)
- Litt kjennskap til moderne sekvensering
- Grunnleggende om sekvens-sammenstillinger, parvise, multiple, databasesøk (BLAST)
- Grunnleggende om fylogeni
Introduksjon til statistikk (STAT100)
- Kjennskap til stokastiske variable og parametre
- Grunnleggende sannsynlighets-regning, betingede sannsynligheter
Introduksjon til programmering (STIN100)
- Kjenne datatypene numeric, character, logical, factor
- Kjenne datastrukturene vector (array), matrise, tabell (tibble/data.frame), liste
- Kjenne til konsepter som løkker og funksjoner/metoder

Emnet krever ingen avansert koding, men vi har heller ingen tid til generell opplæring i koding. All koding vil foregå i R eller shell (bash).

Strukturert undervisningstid

6 timer med aktiv undervisning per uke. Dette er en blanding av forelesninger, "hands-on"-øvinger og oppgaveløsning i grupper

Undervisnings og vurderingsperiode

Emnet starter i høstparallellen. Emnet har undervisning/vurdering i høstparallellen.

Undervisningsmetode for emnet

3 dobbelt-timer ukentlig (opp til 60 studenter). Må ha rom der alle kan bruke egen PC (uttak av strøm, trådløs dekning)

2. Vurderingsform:

4,8

Vurderingsinfo

Mappevurdering Karakterregel: Bestått/ Ikke bestått

Generell adgangsinformasjon for emnet

Realfag

3. Alt i alt, tilfredshet med emnet:

5,2

Antallsbegrensning

Beskrivelse av eksamen for kurset

Mappevurdering. Det blir gitt flere prosjektoppgaver, og alle prosjekter må være bestått for at emnet skal være bestått.

Emneansvarlig

Lars-Gustav Snipen

Emnefrekvens

Oddetallsår

Evaluering svarprosent:

52%

Fortrinnsrett

M-BIAS, M-BIOTEK, M-KB, M-GS

Informasjon om KI-bruk i emnet

K3: Vi oppfordrer til å bruke AI som et verktøy for å støtte egen læring - som en diskusjons-partner, til forbedring av språk eller å foreslå R-kode. Men alt innlevert arbeid må være et produkt av eget arbeid og egen forståelse. Direkte kopiering av AI-generert innhold uten betydelig personlig bidrag, redigering, kommentering eller diskusjon er ikke tillatt. Hvis du bruker AI skal det oppgis eksakt hvilken AI som ble brukt og til hva den ble brukt.

Læringsaktiviteter

Emnet baserer seg på en digital plattform bestående av skriftlig materiale i form av en serie markdown-dokumenter og en rekke filmer (screencast).
All fysisk undervisning foregår gjennom ukentlige øvingstimer, som brukes til diskusjon og oppklaring rundt oppgaver, samt enkle forelesninger over temaer det ønskes utdypning av.
Det avsettes også tid til muntlig presentasjon av prosjekter.

Læringsstøtte

Aktiv bruk av Canvas.

Medvirkende lærere

Tahir Mehmood.

Merknader

Studenter må ha egen laptop til øvinger.

Normert arbeidsmengde

70 t med veiledning tilstede.
180 t egeninnsats.

Obligatoriske aktiviteter

Det skal skrives en rapport over et tema som vil bli annonsert ved emnets oppstart. Det skal også holdes en muntlig presentasjon av rapporten.

Overlapp

Pensum

Vil bli spesifisert ved emnets oppstart.

Publiseres på interne nettsider J/N

Sensor

Intern sensur.
Ekstern sensor godkjenner opplegg for vurdering.

Skriftlig eksamen i eksamensperioden (J/N)

Nei

Kilde: Data hentet fra Felles studentsystem ved NMBU, slik den var publisert for høsten 2026. NMBU har ikke kvalitetssikret og er ikke ansvarlig for innholdet på denne siden.

Kommentarer

Hva burde andre vite før de tar dette? Anonymt, ingen innlogging.

Ofte stilte spørsmål

Hvor mange studiepoeng er BIN310?: BIN310 (Utvalgte emner i mikrobiell genomikk) ved NMBU gir 10 studiepoeng.
Hva er strykprosenten i BIN310?: Samlet strykprosent for BIN310 ved NMBU er 12,3 %, basert på 187 kandidater. Siste semester (høst 2025) var den 14,6 %.
Hvor kommer tallene for BIN310 fra?: Karakterdataene er hentet fra DBH (Database for statistikk om høyere utdanning) hos HK-dir, publisert under NLOD. Studentvurderingene er våre egne, slått sammen med vurderinger fra Karakterweb.

Studieprogram med dette emnet

Basert på hvor kandidatene til eksamen var registrert (DBH).

Relaterte emner ved NMBU

Emner som tas i de samme studieprogrammene som BIN310.

BIN315 Utvalgte emner i funksjonell genomikk 8,9 % stryk
BIO322 Avanserte emner i genomikk snitt C · 3,5 % stryk
BIO335 Anvendt biokatalyse og bioraffinering 12,8 % stryk
KJB310 Proteinkjemi snitt C · 13,4 % stryk
BIO332 Eksperimentell molekylær mikrobiologi snitt C · 1,6 % stryk
BIN210 Introduksjon i bioinformatikk snitt C · 0,7 % stryk
BIO305 Introduksjonsemne for masterstudenter på KBM 7,1 % stryk
STIN300 Statistisk programmering i R 0,6 % stryk

Mer om NMBU

Les om karakterfordelingen ved NMBU →Les om NMBU →

Utvikling over tid

Semester	Kandidater	Stryk
Høst 2025	41	14,6 %
Høst 2023	47	10,6 %
Høst 2021	54	13 %
Vår 2020	5	0 %
Høst 2019	27	18,5 %
Høst 2017	13	0 %

Finner retningen …

Eksamen og forkunnskaper

Vurderingen består av

En muntlig prøve
Langsgående vurdering
Mappevurdering
Selvstendige oppgaver

Alle delene må normalt være bestått. Karakterfordelingen over gjelder emnet samlet.

Kilde: Data hentet fra Felles studentsystem ved NMBU, slik den var publisert for høsten 2026. NMBU har ikke kvalitetssikret og er ikke ansvarlig for innholdet på denne siden.

Om BIN310

NMBU sin egen emnebeskrivelse — læringsutbytte, innhold og vurderingsform.

Emnets innhold

Moderne sekvenseringsteknologi, shotgun og amplicon-sekvensering.
Assemblering og annotering av prokaryote genomer og metagenomer.
Komparativ genomikk og metagenomikk.
Analyse av data fra mikrobielle samfunn.
Bruk av tungregne-ressurser.

Kompetanse i bioinformatikk kan brukes for bidra til alle bærekraftsmål som innvolerer biologi (helse, mat, natur).

Vis resten (30 avsnitt)

Link til informasjon om emnet

http://www.umb.no/?avd=12&visemne=BIN310&language=nb&deflang=1

1. Undervisning/læringsutbytte:

5,6

Læringsutbytte

KUNNSKAPER:

Skal kjenne til en rekke relevante bioinformatiske verktøy som benyttes innen mikrobiell genomikk, samt ideene bak de vanligste algoritmene knyttet til disse.
Bli kjent med et UNIX regne-cluster og enkel bruk av shell-scripting.
Kjenne til noen vanlige statistiske metoder for metagenomstudier og anvende disse på reelle data gjennom bruk av R og R-pakker.

FERDIGHETER:

Studentene skal kunne anvende elementer av temaene over til å løse problemer i prosjektoppgaver i emnet.
Lage enkle script i shell og R og kjøre tyngre analyser på et UNIX regne-cluster.
Studentene skal kunne presentere fagaktuelt materiale, både muntlig og skriftlig.

GENERELL KOMPETANSE:

Kunne sette seg inn i framtidens pipelines for (meta)genomstudier.
Praktisk programmeringskompetanse rettet mot analyse av bio-data.

Anbefalte forkunnskaper

Programmering, samt statistikk utover introduksjonsnivå.

Forutsatte forkunnskaper

Introduksjon til bioinformatikk (BIN210)
- Litt kjennskap til moderne sekvensering
- Grunnleggende om sekvens-sammenstillinger, parvise, multiple, databasesøk (BLAST)
- Grunnleggende om fylogeni
Introduksjon til statistikk (STAT100)
- Kjennskap til stokastiske variable og parametre
- Grunnleggende sannsynlighets-regning, betingede sannsynligheter
Introduksjon til programmering (STIN100)
- Kjenne datatypene numeric, character, logical, factor
- Kjenne datastrukturene vector (array), matrise, tabell (tibble/data.frame), liste
- Kjenne til konsepter som løkker og funksjoner/metoder

Emnet krever ingen avansert koding, men vi har heller ingen tid til generell opplæring i koding. All koding vil foregå i R eller shell (bash).

Strukturert undervisningstid

6 timer med aktiv undervisning per uke. Dette er en blanding av forelesninger, "hands-on"-øvinger og oppgaveløsning i grupper

Undervisnings og vurderingsperiode

Emnet starter i høstparallellen. Emnet har undervisning/vurdering i høstparallellen.

Undervisningsmetode for emnet

3 dobbelt-timer ukentlig (opp til 60 studenter). Må ha rom der alle kan bruke egen PC (uttak av strøm, trådløs dekning)

2. Vurderingsform:

4,8

Vurderingsinfo

Mappevurdering Karakterregel: Bestått/ Ikke bestått

Generell adgangsinformasjon for emnet

Realfag

3. Alt i alt, tilfredshet med emnet:

5,2

Antallsbegrensning

Beskrivelse av eksamen for kurset

Mappevurdering. Det blir gitt flere prosjektoppgaver, og alle prosjekter må være bestått for at emnet skal være bestått.

Emneansvarlig

Lars-Gustav Snipen

Emnefrekvens

Oddetallsår

Evaluering svarprosent:

52%

Fortrinnsrett

M-BIAS, M-BIOTEK, M-KB, M-GS

Informasjon om KI-bruk i emnet

Læringsaktiviteter

Emnet baserer seg på en digital plattform bestående av skriftlig materiale i form av en serie markdown-dokumenter og en rekke filmer (screencast).
All fysisk undervisning foregår gjennom ukentlige øvingstimer, som brukes til diskusjon og oppklaring rundt oppgaver, samt enkle forelesninger over temaer det ønskes utdypning av.
Det avsettes også tid til muntlig presentasjon av prosjekter.

Læringsstøtte

Aktiv bruk av Canvas.

Medvirkende lærere

Tahir Mehmood.

Merknader

Studenter må ha egen laptop til øvinger.

Normert arbeidsmengde

70 t med veiledning tilstede.
180 t egeninnsats.

Obligatoriske aktiviteter

Det skal skrives en rapport over et tema som vil bli annonsert ved emnets oppstart. Det skal også holdes en muntlig presentasjon av rapporten.

Overlapp

Pensum

Vil bli spesifisert ved emnets oppstart.

Publiseres på interne nettsider J/N

Sensor

Intern sensur.
Ekstern sensor godkjenner opplegg for vurdering.

Skriftlig eksamen i eksamensperioden (J/N)

Nei

Kilde: Data hentet fra Felles studentsystem ved NMBU, slik den var publisert for høsten 2026. NMBU har ikke kvalitetssikret og er ikke ansvarlig for innholdet på denne siden.

Ofte stilte spørsmål

Hvor mange studiepoeng er BIN310?

BIN310 (Utvalgte emner i mikrobiell genomikk) ved NMBU gir 10 studiepoeng.

Hva er strykprosenten i BIN310?

Samlet strykprosent for BIN310 ved NMBU er 12,3 %, basert på 187 kandidater. Siste semester (høst 2025) var den 14,6 %.

Hvor kommer tallene for BIN310 fra?

Karakterdataene er hentet fra DBH (Database for statistikk om høyere utdanning) hos HK-dir, publisert under NLOD. Studentvurderingene er våre egne, slått sammen med vurderinger fra Karakterweb.

Semester

Kandidater

Stryk

Høst 2025

14,6 %

Høst 2023

10,6 %

Høst 2021

13 %

Vår 2020

0 %

Høst 2019

18,5 %

Høst 2017

0 %

Karakterfordeling og studentvurderinger i BIN310

Studentvurdering

Hvor relevant opplever du emnet?

Hva er ditt generelle inntrykk av kurset?

Hva synes du om emnets nivå?

Hva synes du om arbeidsmengden sett i forhold til antall studiepoeng?

Eksamen og forkunnskaper

Vurderingen består av

Om BIN310

Emnets innhold

Link til informasjon om emnet

1. Undervisning/læringsutbytte:

Læringsutbytte

Anbefalte forkunnskaper

Forutsatte forkunnskaper

Strukturert undervisningstid

Undervisnings og vurderingsperiode

Undervisningsmetode for emnet

2. Vurderingsform:

Vurderingsinfo

Generell adgangsinformasjon for emnet

3. Alt i alt, tilfredshet med emnet:

Antallsbegrensning

Beskrivelse av eksamen for kurset

Emneansvarlig

Emnefrekvens

Evaluering svarprosent:

Fortrinnsrett

Informasjon om KI-bruk i emnet

Læringsaktiviteter

Læringsstøtte

Medvirkende lærere

Merknader

Normert arbeidsmengde

Obligatoriske aktiviteter

Overlapp

Pensum

Publiseres på interne nettsider J/N

Sensor

Skriftlig eksamen i eksamensperioden (J/N)

Kommentarer

Ofte stilte spørsmål

Studieprogram med dette emnet

Relaterte emner ved NMBU

Mer om NMBU

Utvikling over tid

Karakterfordeling og studentvurderinger i BIN310

Studentvurdering

Hvor relevant opplever du emnet?

Hva er ditt generelle inntrykk av kurset?

Hva synes du om emnets nivå?

Hva synes du om arbeidsmengden sett i forhold til antall studiepoeng?

Eksamen og forkunnskaper

Vurderingen består av

Om BIN310

Emnets innhold

Link til informasjon om emnet

1. Undervisning/læringsutbytte:

Læringsutbytte

Anbefalte forkunnskaper

Forutsatte forkunnskaper

Strukturert undervisningstid

Undervisnings og vurderingsperiode

Undervisningsmetode for emnet

2. Vurderingsform:

Vurderingsinfo

Generell adgangsinformasjon for emnet

3. Alt i alt, tilfredshet med emnet:

Antallsbegrensning

Beskrivelse av eksamen for kurset

Emneansvarlig

Emnefrekvens

Evaluering svarprosent:

Fortrinnsrett

Informasjon om KI-bruk i emnet

Læringsaktiviteter

Læringsstøtte

Medvirkende lærere

Merknader

Normert arbeidsmengde