BIO332 Eksperimentell molekylær mikrobiologi

Kunnskaper

Emnet er tett knyttet til aktuelle forskningstemaer innenfor mikrobiologi og formidler «state-of-the-art»-kunnskap om tre viktige temaer som er spesielt relevante for FNs bærekraftsmål om god helse og stopp av klimaendringer: Mikrobielle prosesser involvert i klimagassutslipp; horisontal genoverføring og dens betydning for spredning av antibiotika-resistens; og sammenhenger mellom tarmflora-sammensetning og helse. Emnet gir også forståelse av prinsippene bak flere av de vanligst brukte teknikkene innen moderne mikrobiologi.

Ferdigheter

Kurset gir god trening i mange av de vanligste teknikkene som brukes innen moderne mikrobiologi, med hovedvekt på molekylære metoder. Studentene lærer hvordan de ulike metodene kan brukes, og deres styrker/svakheter. Laboratorieøvelsene er lagt opp som forskningsprosjekter som sammenfattes i en individuell, skriftlig rapport. Dette gir ferdigheter i utføring og planlegging av eksperimenter; data-analyse og - fremstilling; og trening i innsamling av relevant litteratur for å sette inn resultatene i en bredere sammenheng. Regelmessige seminarer blir holdt, hvor studentene får øvelse i å sammenfatte og diskutere utvalgte vitenskapelige artikler.

Studenten kan selv gjennomføre de forberedelser, teknikker og analyser som inngår i emnet. Studenten behersker instrumentene og utstyret som benyttes i emnet.

Generell kompetanse

Emnet gir studentene god praktisk og teoretisk forberedelse for gjennomføring av masteroppgave og er også nyttig for studenter i tidlig fase av ph.d.-utdanningen. Emnet innebærer både samarbeid i gruppe og individuell øvelse i skriving og data-analyse, og gir trening i skriftlig og muntlig fremstilling, i løsning av komplekse problemer, og i kritisk lesing og tolking av vitenskapelige tekster.

• Biokjemi tilsvarende KJB200
• Generell mikrobiologi tilsvarende BIO230
• Molekylærbiologi tilsvarende BIO210

Januarblokk: 3 ukers (120 timer) laboratoriekurs, med enkelte forelesninger. Hele dager må påregnes.

Vårparallell: 2 dobbettimer med seminarer/forelesninger per uke i første halvdel av vårparallellen, annonseres på Canvas.

Innlevering av skriftlig rapport: uke 11 eller 12. Skriftlig eksamen er normalt i uke 13, 14 eller 15, avhengig av når påsken er.

Dette er et intensivt og innholdsrikt laboratoriekurs og kurssalen BT2A.08 og BT2A.05 trengs fulle dager hele januarblokka. I tillegg trenger vi ett forelesnings/seminarrom for 36 studenter i BTB-bygget hver morgen kl 8-10 (helst BT3A.16, Rossings rom).

I de 12 første ukene av vårparallellen (10 x 2 h) trenger vi også et forelesningsrom for 36 studenter og to grupperom (med projektor for studentpresentasjoner) som tar 12 studenter hver. Disse tre rommene må ligge så nære hverandre som mulig. NB!!! Tilgang på grupperom er meget viktig for at vi skal kunne arrangere seminarer (i 3-4 grupper) som er en obligatorisk aktivitet. Det store rommet kan da brukes for seminar og for en felles gjennomgang før/etterpå.

Samlet vurdering (A-F):

• Skriftlig eksamen (teller 60 %)
• Rapport (teller 40 %)
• Alle delvurderinger må være bestått for å bestå emnet

Skriftlig eksamen blir studenten spurt om innholdet fra labkurset og pensum som består av utvalgte vitenskapelige artikler innen relaterte temaer. Vurderes med karakter A-F og teller 60 % av totalkarakteren.

Skriftlig rapport av eksperimentell forskningsoppgave. Skal skrives som et vitenskapelig manuskript og vurderes med karakter A-F, og teller 40% av totalkarakteren. Ved karakter F (stryk), må studenten levere ny rapport tidligst neste undervisningsperiode for kurset.

Studenter som har bestått én eller flere delvurderinger trenger ikke ta alle på nytt ved gjentak av emnet.

• Master i Bioteknologi med fordypning i mikrobiologi (dvs masteroppgave innen mikrobiologi)
• Master i teknologi (siv.ing.), studieretning kjemi og bioteknologi, spesialisering molekylærbiologi

Bruk av kunstig intelligens (KI) som et hjelpemiddel er tillatt i arbeidet med skriftlig oppgave (labrapport), forutsatt at bruken er i samsvar med NMBU's gjeldende retningslinjer (https://www.nmbu.no/retningslinjer-bruk-av-kunstig-intelligens-ki-ved-nmbu). Det er studentenes ansvar å gjøre seg kjent med og følge disse retningslinjene.

Altså,

Skriftlig oppgave (labrapport): K3 - Full bruk av KI, så lenge dette følger NMBUs retningslinjer for bruk av KI.

Eksamen: K1 - ingen bruk av KI tillatt.

• Laboratorieøvelser.
• Seminarer.
  • Seminarene innebærer presentasjon og diskusjon av artikler og metoder, hvor også studentene deltar aktivt. Hovedfokuset i kurset er å gi studentene innsikt i noen utvalgte metoder som er aktuelle i dagens mikrobiologiske forskning. Spesialforelesninger gis i tilknytning til laboratorieøvelsene, eller som separate forelesninger/seminarer.

Knut Rudi, Morten Nilsen, Morten Kjos

Else Marie Aasen, Rannei Tjåland, Zhian Salehian, Pawel Lycus, Inga Leena Angell, Marita Torrissen Mårli, Marte Maråk, Maria Disen Barbuti, Ida Ormaasen, Martin Menestreau, Alicia Caro Pascual

• Laboratoriearbeid: 120 timer.
• Seminarer/forelesninger: 18 timer.
• Resulatbearbeiding, selvstudier og skriving av fyldig rapport fra laboratorieøvelsene: 112 timer.

• Hovedlærere for de tre respektive temaene i kurset fungerer som interne sensorer.
• Ekstern sensor vurderer rapporter og skriftlig eksamen.

N

Skriftlig eksamen gis normalt i uken rett før eller rett etter påskeuken og altså utenfor eksamensperioden, i overenskomst med studentene,

Hvis studenttallet er under 24 kan lærerne beslutte at det blir muntlig avsluttende eksamen