TBT4507 Bioinformatikk og Forsøksplanlegging og dataanalyse, fordypningsemne

Forsøksplanlegging og dataanalyse: Studenten har kunnskap om de grunnleggende statistiske modeller og metoder som benyttes innen naturvitenskap og teknologi. Studenten kan tolke resultater av hypotesetesting, regresjonsanalyse, forsøksplanlegging, variansanalyse og ikke-parametriske metoder. Studenten kan bruke dataprogrammer for statistiske beregninger og analyser.

Bioinformatikk: Studenten forstår genomsekvenseringsmetoder og deres begrensninger. Studenten kan anvende beregningsverktøy for genomsamling og annotering. Studenten kan forklare prinsippene og anvendelsene av sekvensjustering. Studenten kan trekke ut informasjon fra bioinformatiske databaser og skrive Python-skript for å behandle og analysere flere typer data. Studenten kan kombinere data fra forskjellige bioinformatiske databaser for å analysere funksjonen til gener og proteiner.

Forsøksplanlegging og dataanalyse: Grunnkurs i Statistikk fra BSc.

Bioinformatikk: Introduksjon til Python (TDT4110 eller tilsvarende), Celle- og molekylærbiologi (BI1001 eller tilsvarende), Biokjemi (TBT4102 eller tilsvarende).

Forsøksplanlegging og dataanalyse: Antall øvinger er 4, alle må være godkjent for å gå opp til eksamen. Skriftlig eksamen (3t).

Bioinformatikk: Gruppeprosjekt med gruppepresentasjon og individuell rapport.

Hver karaktergivende del (skriftlig eksamen i Forsøksplanlegging og dataanalyse, prosjektet i Bioinformatikk) teller 50 % av karakteren i emnet.

Både prosjektet og skriftlig eksamen må være bestått for å få bestått i emnet.

Ved utsatt eksamen kan skriftlig eksamen bli endret til muntlig eksamen. Ved stryk eller gjentak kan studenter velge å ta bare én av vurderingsdelene på nytt.

Probability and Statistics for Engineers and Scientists (9th Edition) by Ronald E. Walpole.

Bioinformatikk: forelesningsslides og dokumentasjon for relevante verktøy og databaser (gitt under forelesningene).

Forsøksplanlegging og dataanalyse: Forelesninger (24 t), øvinger (8 t) og selvstudium (64 t).

Bioinformatikk: Ukentlige forelesninger (8 x 3 timer) fordelt på teori (1 time) og dataøvelser (2 timer). Gruppeprosjekt og hjemmearbeid (selvstudium).